Основные направления деятельности Ботанического сада-института:

1. Проведение фундаментальных, поисковых и прикладных научных исследований по следующим направлениям:
• изучение и сохранение генофонда флоры востока Азии;
• биологические основы интродукции растений;
• изучение адаптаций растений в условиях изменяющегося климата;
• изучение антропогенных и климатогенных изменений растительного покрова.
2. Выполнение научно-исследовательских работ в рамках федеральных и региональных научных программ и проектов, разработка научных прогнозов и проведение научно-технических экспертиз.
3. Осуществление инновационной деятельности и практическая реализация завершенных научных разработок.
4. Учреждение научных изданий, выпуск монографий, сборников, журналов, учебно-методической литературы.
5. Осуществление образовательной деятельности по основным профессиональным образовательным программам высшего образования - программам магистратуры, программам подготовки научно­педагогических кадров в аспирантуре; основным программам профессионального обучения - программам профессиональной подготовки по профессиям рабочих, должностям служащих, программам переподготовки рабочих, служащих, программам повышения квалификации рабочих, служащих; дополнительным профессиональным программам - программам повышения квалификации, программам профессиональной переподготовки.
6. Осуществление подготовки научных кадров в докторантуре.
7. Организация и проведение конференций, совещаний симпозиумов, семинаров, школ и других научных мероприятий, в том числе международных или с участием иностранных ученых.
8. Разработка, планирование и проведение мероприятий по эколого-ботаническому образованию и просвещению.
9. Создание и поддержание коллекций растений (живых растений в открытом и закрытом грунте, живых растений на питательных средах in vitro, гербария, гермоплазмы растений).
10. Интродукция и селекция хозяйственно ценных растений, получение растений с заданными свойствами.
11. Организация и проведение обмена биоматериалом (живые растения и их части, гербарий, семена) в соответствии с законодательством Российской Федерации с другими организациями, в том числе зарубежными.
12. Организация и развитие опытных производств.
13. Осуществление комплекса мероприятий по поддержанию закрепленной за Учреждением особо охраняемой природной территории федерального значения в соответствии с Федеральным законом «Об особо охраняемых природных территориях».
14. Проведение научных исследований по проектам, получившим финансовую поддержку (гранты) государственных научных фондов Российской Федерации, других государственных и негосударственных фондов, международных и иностранных организаций.
15. Проведение экскурсионной деятельности и популяризация научных знаний.