СТРУКТУРА БСИ ДВО РАН (головная организация, Владивосток)
Администрация
Аппарат управления
Бухгалтерия
Отдел кадров
Научный отдел
Лаборатория флоры
Группа "Гербарий VBGI"
Лаборатория криптогамной биоты
Лаборатория геоботаники
Лаборатория интродукции и селекции
Группа биотехнологии растений
Группа «Семенной фонд»
Научно-производственный отдел
Группа коллекций закрытого грунта
Агротехническая группа
Лесопарковая группа
Отдел эколого-ботанического просвещения
Эксплуатационно-технический отдел
СТРУКТУРА АМУРСКОГО ФИЛИАЛА БСИ ДВО РАН (Благовещенск)
Администрация
Аппарат управления
Бухгалтерия
Научный отдел
Лаборатория ботаники и защиты растений
Лаборатория интродукции
Группа биотехнологии и биохимии растений
Хозяйственный отдел
Группа обеспечения жизнедеятельности инфраструктуры
СТРУКТУРА САХАЛИНСКОГО ФИЛИАЛА БСИ ДВО РАН (Южно-Сахалинск)
Администрация
Научный отдел
Группа ботаники
Группа содержания коллекционного фонда
Хозяйственный отдел
Группа обеспечения жизнедеятельности инфраструктуры