Значительную площадь Ботанического сада-института ДВО РАН занимают экспозиции и коллекции древесных растений.
Они начинаются вблизи главных ворот. Слева расположена группа растений — сосна корейская или «кедр» корейский (Pinus koraiensis Siebold et Zucc.), сосна веймутова (Pinus strobus L.) и ель колючая (декоративная форма с голубой хвоей) (Picea pungens Engelm. "Glauca"). Родина последних двух видов — Северная Америка. На фоне тополя (сорт «Лидия» селекции Н.А. Коновалова, г. Екатеринбург) (Populus alba L. × Populus bolleana Lanch.) — тис остроконечный (Taxus cuspidata Siebold et Zucc.).
Далее — каменная горка, покрытая лианами девичьего винограда триостренного (Parthenocissus tricuspidata (Siebold et Zucc.) Planch.). Вблизи бетонной дороги, поворачивающей налево, около теплицы произрастает каштан конский обыкновенный (Aesculus hippocastanum L.) родом с Балканского полуострова — ценное декоративное, особенно в период цветения (конец мая — начало июня), и лекарственное растение.
Налево — группа хвойных из двух видов: пихты цельнолистной (Abies holophylla Maxim.) и ели канадской, или сизой (Picea glauca (Moench) Voss.). Далее произрастает местное орехоплодное растение орех маньчжурский (Juglans mandshurica Maxim.).
Направо от дороги — тропинка из бетонных плит углубляется в коллекцию сортовых сиреней. Здесь же произрастают представители рода катальпа, родиной которых являются Северная Америка и Китай. У катальпы бигнониевидной (Catalpa bignonioides Walt.) декоративны крупные соцветия с белыми цветками, которые словно веснушками украшены яркими коричнево-красными крапинками и желтыми полосками. Цветки катальпы яйцевидной (Catalpa ovata G. Don f.) желтоватые с оранжевыми полосками и фиолетовыми крапинками внутри, более мелкие. Листья очень крупные (до 25 см длиной). Рядом с катальпой находятся виды: вейгела цветущая (Weigela florida (Bunge) A. DC. var. venusta (Rehd.) Nakai), можжевельник гибридный (Juniperus × media Van Melle (J. chinensis × J. sabina)), можжевельник Саржента (Juniperus sargentii (A. Henry) Takeda ex Koidz.), туя западная (Thuja occidentalis L.) и её формы.
Далее вдоль грунтовых дорожек — гортензия метельчатая (Hydrangea paniculata Siebold "Grandiflora") и гортензия древовидная (Hydrangea arborescens L.) — крупноцветковые садовые формы, пестролистная форма бузины черной (Sambucus nigra L. "Argenteomarginata") и бузины чёрной с золотистыми листьями (Sambucus nigra L. "Aurea"), можжевельник твердый форма прибрежная (Juniperus rigida Siebold et Zucc. "Litoralis"), туя западная (Thuja occidentalis L.), пирамидальная форма вяза шершавого (Ulmus glabra Huds. f. fastigiata), ива извилистая (декоративная форма), рододендрон японский с жёлтыми и лососево-розовыми цветками (Rhododendron japonicum (A.Gray) Suringar), рододендрон канадский (Rhododendron canadense (L.) Torr.), причём имеются экземпляры как с обычными сиренево-розовыми, так и с более редкими белыми цветками. У рододендрона клейкого (Rhododendron viscosum (L.) Torr.) в коллекции также имеются особи с белыми и розовыми цветками, особи рододендрона тупого (Rhododendron obtusum (Lindl.) Planch.) с цветками светло-розовой, сиренево-розовой и пурпурно-фиолетовой окраски.
Здесь же находится гинкго двулопастной (Ginkgo biloba L.). Это одно из древнейших древесных растений, сохранившихся на Земле в живом виде, единственный представитель семейства. Растение декоративно благодаря оригинальным светлым вееровидным желтовато-зеленым листьям. Представляет ценность как лекарственное растение.
В конце левой дорожки — круглая клумба с можжевельником даурским (Juniperus davurica Pall.). В этой части экспозиции находится калина обыкновенная сорт «Снежный Шар» (Viburnum opulus L. "Roseum" 'Sterilis').
Рододендроны расположены на всей экспозиции — более 20 видов и форм, то есть: рододендрон золотистый (Rhododendron aureum Georgi), рододендрон канадский (Rhododendron canadense (L.) Torr.) — 2 формы, рододендрон катевбинский (Rhododendron catawbiense Michx.), рододендрон кавказский (Rhododendron caucasicum Pall.), рододендрон японский (Rhododendron japonicum (A.Gray) Suringar) — 3 формы, рододендрон желтый (Rhododendron luteum Sweet), рододендрон крупнейший (Rhododendron maximum L.), рододендрон тупой (Rhododendron obtusum (Lindl.) Planch.) — 3 формы, рододендрон пукханский (Rhododendron poukhanense H.Lév.), рододендрон розоватый (Rhododendron roseum (Poisel) Rehd.), рододендрон Шлиппенбаха (Rhododendron schlippenbachii Maxim.), рододендрон сихотинский (Rhododendron sichotense Pojark.), рододендрон Смирнова (Rhododendron smirnowii Trautv.), рододендрон Вазея (Rhododendron vaseyi A.Gray), рододендрон клейкий (Rhododendron viscosum (L.) Torr.) — 3 формы, рододендрон мелкоцветковый (Rhododendron micranthum Turcz.) и др.
Рододендроны — одна из самых декоративных и интересных групп древесных растений, пользующаяся большой популярностью во всем мире. В условиях экспозиции цветение продолжается в мае и июне. Первым зацветает рододендрон сихотинский (конец апреля), последним (июль) — рододендрон мелкоцветковый (родина этого вечнозеленого вида — Китай). Массовое цветение большинства видов рододендрона отмечается в мае. В этот период экспозиция очень декоративна. Из вечнозеленых рододендронов наибольшей декоративностью характеризуются рододендрон катевбинский и рододендрон Смирнова.
Самой ценной на этой экспозиции следует считать коллекцию магнолий. Магнолии относятся к наиболее древним цветковым растениям. Их естественный ареал — Восточная Азия и Гималаи, Северная и Центральная Америка. Растения магнолии характеризуются высокими декоративными качествами цветков, листьев, плодов, поэтому весьма популярны во многих странах.
Цветение магнолии начинается в первых числах мая. Первыми распускаются цветки у магнолии кобус (родина — Япония). После нее цветет магнолия Суланжа (конец мая — начало июня). Цветки этого вида магнолии достигают 15 см в диаметре, бокаловидные, весьма декоративные (лепестки снаружи окрашены в ярко-розовый цвет, внутри — белый). Цветение магнолии Зибольда отмечается с середины июня в течение месяца. К этому времени у нее полностью формируются листья, и на их фоне белые цветки с карминными тычинками очень декоративны. Продолжительность жизни каждого цветка около 10 дней.
Вдоль аллеи сакур растет метасеквойя рассечённошишечная (Metasequoia glyptostroboides Hu et Cheng) — вид, как и весь род, считавшийся давно вымершим. В 1948 г. китайские ботаники установили наличие этого вида в естественных местообитаниях Китая. История этого реликтового растения представляет интерес для ботаников и туристов. По внешнему виду оно напоминает лиственницу. Однако на зиму у дерева опадает не только хвоя, но и ветви.
Экспозиция напротив главного входа в Ботанический сад-институт (перед лабораторным корпусом) представлена рядом жизненных форм древесных растений. Слева от входа в здание на перголу у стен поднимается лиана древогубца плетеобразного (Celastrus flagellaris Rupr.) — дальневосточного вида. Направо от него — кипарисовик горохоплодный (Chamaecyparis pisifera (Siebold et Zucc.) Siebold et Zucc.) (родина — Япония), можжевельник твердый пирамидальной формы (Juniperus rigida Siebold et Zucc.), можжевельник Саржента (Juniperus sargentii (A. Henry) Takeda ex Koidz.) с чешуевидной зелено-голубой хвоей, рододендрон Шлиппенбаха (Rhododendron schlippenbachii Maxim.), рододендрон сихотинский (Rhododendron sichotense Pojark.), рододендрон остроконечный (Rhododendron mucronulatum Turcz.).
Ближе к зданию расположены кусты форзиции яйцевидной (Forsythia ovata Nakai). Направо от главного входа на территории института рядом с забором размещена группа сосны корейской, далее — можжевельник твердый (прибрежная форма), сумах (пушистый форма с рассеченными листьями). За группой деревьев сосны обыкновенной (Pinus sylvestris L.) произрастает магнолия Лебнера, кипарисовик горохоплодный.
Далее расположена группа из боярышника Максимовича (Crataegus maximowiczii Schneid.), граба сердцелистного (Carpinus cordata Blume), триптеригиума Регеля (Tripterygium regelii Sprague), а в глубине посадок — древний реликтовый вид береза железная (Betula schmidtii Regel), также внесенный в Красную книгу.
В центре асфальтированного участка на треугольной клумбе находятся: абрикос маньчжурский (Armeniaca mandshurica (Maxim.) Skvorts.), пихта цельнолистная (Abies holophylla Maxim.), ель (Picea sp.).
Налево от двухэтажного административного здания находится экспозиция хвойных растений, состоящая из туи западной, можжевельника даурского, можжевельника твердого, можжевельника Саржента, плосковеточника восточного (Platycladus orientalis (L.) Franco), ели колючей, тиса остроконечного. В центре участка размещены деревья вишни Саржента, весьма декоративной ранней весной (покрывается розовыми цветками).
